生物質熱解氣化得到的粗燃氣中，含有焦油蒸氣、水蒸氣和粉塵等雜質。如果將熱的粗燃氣直接用作鍋爐或工業窯爐的燃料，可以不必清除這些雜質。但大多數應用場合要求使用潔凈的冷燃氣，例如內燃機或燃氣輪機燃料氣、合成原料氣或通過管道輸送燃氣，這時必須將燃氣冷卻，并且清除燃氣中焦油和粉塵，否則會給下游管道和用氣設備帶來危害。一般來說，管道輸送的燃氣總雜質含量應低于20mg/m3；內燃機用燃氣應低于50mg/m3；而合成氣或燃料電池則對燃氣雜質含量提出了每立方米數十和幾毫克的更高要求。

 生物質熱解氣化過程總是伴隨著焦油的產生，清除燃氣中焦油是一個受到普遍關注的難點問題。伴隨生物質氣化技術的發展，出現了許多焦油凈化技術和裝置。技術途徑主要有兩種:一是將焦油消滅在氣化過程中，通過熱裂解和催化裂解措施，盡可能降低燃氣中焦油含量；二是通過分離手段將燃氣中焦油和固體灰塵清除，最后得到清潔的燃氣。

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